XII. FOTOSÍNTESIS EN CYANOBACTERIAS

La presente lectura es el punto de convergencia de todas las lecturas previamente desarrolladas sobre el fenómeno de la fotosíntesis, como seguramente será también el punto de partida de las próximas, no como estrategia de redacción, sino porque debe ser así, y solo así, pues este grupo bacteriano fué hace 2,500 millones de años punto de convergencia de evolución Marguliana, como también punto de divergencia Darwinista, lo que definió la impronta de la vida en nuestro planeta.

A las cyanobacterias se le debe la atmósfera planetaria rica en oxígeno, su color azul visible desde el espacio, las bandas rojas de hierro Fe3+ (Hematita Fe2O3) y Fe2+/Fe3+ (magnetita), huella geológica de su actividad bioquímica, como también la eucariogénesis y la evolución de las plantas y en último término de los animales pluricelulares, de manera que la especie humana no existiría si hace 2,500 millones de años no hubieran dominado, como dominaron, estas revolucionarias bacterias fotosintéticas.

Las Cyanobacterias son un grupo de bacterias Gram-negativas (Phyllum Cyanobacteriota) caracterizadas por realizar fotosíntesis oxigénica mediante un complejo bioquímico dual PSII-PSI, lo que las diferencia de los demás grupos fotosintéticos bacterianos, donde PSII o PSI están presentes, pero nunca operando a la vez, ver fig 1.

El complejo fotosintético se localiza en invaginaciones intracelulares de la membrana plasmática denominadas membranas Thylakoides, precursoras de las estructuras thylakoidales propias de los cloroplastos presentes en las células del reino vegetal.

Figura 1. Complejo fotosintético de Cyanobacterias

La maquinaria fotosintétic de las cyanobacterias comprende los siguientes subsistemas:

  • Complejo antena (Light Harvest Complex) denominados phycobilisomas, los cuales están intimamente ligados a los fotosistemas PSII y PSI
  • Fotosistemas PSII y PSI propiamente dichos, encargados el primero de reducir quinonas y el segundo reducir NADH
  • Citocromo b6f, transportador de electrones hacia PSI y responsable de la generación del potencial protónico PMF
  • Centro OEC (Oxigen Evolving Center) responsable de la oxidación del agua.
  • ATP Synthase, que, aunque no forma parte del complejo, es fundamental para la síntesis de ATP

A continuación un resumen general de los diferentes componentes de la maquinaria:

PHYCOBILISOMA (PBS)

Durante el proceso de la fotosíntesis, la energía lumínica es capturada por complejos antena denominados Phycobilisomas (PBS). La energía es luego transmitida hacia los centros de reacción (RC), donde pares especiales de clorofilas Chla son exitados a niveles energéticos que permiten la liberación electrónica en Chla para iniciar la cadena de transporte de electrones (ETC) , motor final de las maquinarias fotosintéticas.

Cada Phycobilisoma está compuesto por seis (raramente ocho) estructuras proteicas de corte cilíndrico en disposición radial, ver Fig 2., convergiendo hacia un nucleo proteico central.

Figura 2. Phycobilisoma. A: Vista general. Se incluye con propósito ilustrativo en tonos suaves el centro de reacción. B: Detalle estructural. C: Disposición de subunidades en los trímeros.

RADIOS:

Cada radio a su vez está conformado por 2 – 6 discos de phycobiliproteinas (10-12 nm de diámetro), los cuales actúan como unidades de captura y transferencia de energía lumínica hacia el nucleo del complejo. Los discos, de estructura trimeral, pueden operar de manera individual, trímeros (αβ)3 , o por parejas enlazadas por proteinas linker, en cuyo caso su estructura es hexameral (αβ)₆, ver Fig 2b y 2c. El rol de la proteina linker no es solamente enlazante, también contribuye a ajustar los niveles energéticos y a dirigir la energía hacia el nucleo del complejo antena.

De distal a proximal, y dependiendo de los cromóforos que contienen, las proteinas de los radios se clasifican en:

PHYCOERITHRINAS (PE) → Colectores primarios de luz .

PHYCOCYANINAS (PC) → Transfieren la energía colectada por PE hacia el nucleo del phycobilisoma.

La estructura de los radios puede variar acomodandose a la disponibilidad de energía. Así, PE puede estar ausente, en cuyo caso el colector primario es PC. De manera similar, PC puede faltar, y en ese caso PE comunica directamente con los cromóforos del nucleo.

NÚCLEO

El núcleo está conformado por 2-3 cilindros dispuestos horizontalmente, ver Fig.2a, con 6-9 discos αβ3 por cilindro, agrupados por parejas mediante proteinas linker, resultando en estructuras αβ₆.

La proteina del nucleo corresponde a ALOPHYCOCYANINA (APC), derivando su nombre del pigmento correspondiente, Alophycocyanobilina, el cual es exitado por los cromóforos radiales que actúan a modo de embudo energético. Este pigmento es el responsable de la exitación del par especial de clorofilas localizada en el centros de reaccion.

El núcleo tiene en consecuencia una función conectora entre el complejo antena y el centro de reacción RC, de manera análoga a la capa FMO de los clorosomas propios de las baterias verdes del azufre (ver lectura correspondiente), si bién presentan diferencias significativas:

  1. El núcleo del ficobilisoma es una estructura grande, modular y con alta plasticidad morfológica, adaptable en número de discos y organización de los mismos dependiendo de las condiciones lumínicas, mientras que FMO es un complejo pequeño,rígido en estructura, no adaptable a fluctuaciones de las condiciones ambientales.
  2. El cromóforo contiene Aloficocianina, conecta con el par especial Chla en RC P680 de (PSII y P700 de PSI), mientras que FMO contiene Bacterioclorofila y transmite la energía al par Bchla P840 en RC.
  3. El phycobilisoma requiere para su exitación de una intensidad de luz mucho mayor que el chlorosoma, lo que define y diferencia los nichos ecológicos ocupados por ambos grupos biológicos.
  4. El número de pigmentos presentes en el phycobilisoma es muchísimo menor que el del chlorosoma (decenas en el ficobilisoma, cientos de miles e el corosoma).
  5. Los pigmentos del phycobilisoma requieren proteinas estructurantes donde se anclan y organizan, mientras que la organización y distribución de pigmentos en el chlorosoma obedece a una estructura semicristalina auto-organizada, y salvo la envoltura que los contiene y la unidad conectora (FMO), hay ausencia proteínica al interior del complejo antena.
  6. El phycobilisoma es típico de linajes oxigénicos evolutivamente recientes, mientras que el chlorosoma es típico de fototrofía anoxigénica mucho mas antigua.

PIGMENTOS FOTOSINTÉTICOS

Para que la energía fluya desde el Phycobilisoma hasta PSII/PSI mediante transferencia no radiativa FRET se requiere cumplir un conjunto de condiciones:

  • Energías de exitación decrementales en el sentido del flujo ETC
  • Distancias reducidas entre cromóforos adyacentes
  • Superposición espectral entre las frecuencias de emisión y frecuencias de exitación de pigmentos en la cadena
  • Orientación favorable a FRET entre los dipolos
  • Adecuada vida media de estados exitados

Las proteínas PE, PC y APC contienen los pigmentos de los tipos Phycoerytrobilina, Phycocyanobilina y Alophycocyanobilina respectivamente, cuyas energías de exitación/emisión cumplen las condiciones descritas, lo cual garantiza el flujo de energía en la secuencia

PE → PC → APC → PSII/PSI

El flujo de energía y la tabla de valores de exitación/emisión en el phycobilisoma se ilustran en la Fig 3.

Figura 3. Flujo de energía y valores de absorción/emisión correspondientes a las etapas de flujo de energía en el phycobilisoma

Los pigmentos fotosintéticos obedecen a una estructura tetrapirrólica de anillo abierto, con diferencias en el radical asociado al carbono 18 (Vinil para Phycoerytrobilina, Ethil para Phicocyanobilina y Alophycocyanobilina), y con diferencias en las posiciones de algunos enlaces Pi conjugados entre Phycocyanobilina y Alophycocyanobilina , ver Fig.4.

Estas diferencias moleculares, combinadas con las cargas eléctricas de los aminoácidos que las rodean, definen las energías de absorción/ emisión para cada tipo de pigmento.

Para los tres casos, los pigmentos están anclados a las proteínas vía residuos Cisteína mediante enlaces covalentes Tioéter.

Figura 4. Estructura molecular de los pigmentos involucrados en el phycobilisoma

FOTOSISTEMA PSII

La energía capturada y transmitida desde los pigmentos de las radios hasta el nucleo del complejo es transmitida al par especial de clorofilas localizado en la base del fotosistema PSII, el cual es un complejo de proteínas transmembrana en un arreglo heterodimérico D2-D1, ver Fig.5.

El acoplamiento entre los pigmentos del nucleo y el par especial de clorofilas es mucho mas fuerte y mucho más coherente que el acoplamiento entre pigmentos al interior del phycobilisoma, lo que lo define como un caso extremo de resonancia de Förster, renombrado recientemente como EET (Exitation Energy Transfer)

Figura 5. Fotosistema PSII. Estructura y cadena de transporte ETC.

Mediante EET, la energía procedente del complejo antena exita el par especial de clorofilas P680 llevandolo a su forma P680*, elevando su potencial redox de

+ 1,2 → -0,9 eV

Si los requerimientos energéticos celulares son bajos, el par especial retorna al estado Ground mediante fluorescencia, ver Fig 6.

Figura 6. Exitación/relajación electrónica en pigmentos fotosintéticos

Ante demanda energética, el electrón exitado π* (procedente de la cadena de enlaces conjugados), no retorna a ground sino que se libera oxidando el par especial de clorofilas Chla , iniciando una cadena de transporte de electrones ETC, que en su primera fase (PSII) sigue la ruta ETC

P680* → Pheophytin → Quinone A → Quinonne B → Plastoquinol

El pigmento Phaeophitin corresponde estructuralmente a una molécula de clorofila Chla sin presencia del átomo central de magnesio coordinado. Las quinonas corresponden a Plastoquinonas, muy estables en ambientes ricos en oxígeno.

Para reducirse completamente, las plastoquinonas PQA y PQB requieren dos electrones, de manera que el ciclo de exitación y liberación electrónica del par especial de clorofilas debe repetirse dos veces, y previamente dos fotones deben ser capturados y transmitidos a RC secuencialmente por parte del complejo antena.

Una vez completamente reducida, PQB2- captura dos protones procedentes del citoplasma adquiriendo la forma de Plastoquinol PQH2 :

PQB → PQB∙− → PQB2- → PQH2

Mientras que PQA está ligada fuértemente a PSII, PQB es fácilmente liberada en su forma plasoquinol, migrando a un reservorio especial de quinonas localizado en el espacio intramembrana thylakoidal denominado pool de quinonas, ver Fig 7.

Figura 7. Diagrama de flujo de energía en el complejo fotosintético de Cyanobacterias, reacciones dependientes de luz.

Para que la cadena de transporte ETC siga una dirección “cuesta abajo” desde P680* hasta PQH2 en PSII, (y más adelante hacia el pool de quinonas y finalmente hasta P700 en PSI), los “eslabones” de la cadena de transporte deben estar acoplados de modo que sus potenciales redox vayan disminuyendo paso a paso, ver Fig.8.

El tránsito de electrones a lo largo del proceso, al igual que en los complejos fotosintéticos presentes en los demás grupos bacterianos y en la maquinaria de foforilación oxidativa mitocondrial, permite generar un gradiente protónico intermembrana (PMF) indispensable para la síntesis de ATP.

Figura 8. Diagrama Z en el complejo fotosintético PSII/PSI de Cyanobacterias.

El transito de electrones descrito en la fig. 8 se conoce como ESQUEMA Z, que en resumen describe la forma en “Z” del transporte no cíclico de electrones durante las reacciones dependientes de la luz en la fotosíntesis de cyanobacterias y plantas superiores.

El Esquema “Z” comprende dos fases, correspondientes a PSII y PSI respectivameente. PSI maneja niveles energéticos mayores que PSII, lo que define para PSII un alto poder oxidante y para PSI un alto poder reductor, convirtiendo al sistema combinado en una maquinaria altamente oxidante, altamente reductora, que en la práctica se traduce en capacidad de oxidar H2O y capacidad de reducir NADP+ de manera directa. Comparativamente, maquinarias de un solo fotosistema, como las presentes en bacterias púrpura y bacterias verdes del azufre, la eficiencia fotosintética general está limitada. En las primeras, el débil poder reductor impide la síntesis directa de NADPH, teniento que invertir valioso ATP en su producción, mientras que en bacterias verdes del azufre ocurre lo contrario. Se habilita la síntesis directa de NADPH pero el bajo poder oxidante impide la utilización de H2O como fuente de electrones, ver Fig 9.

Figura 9. Centros de reacción de Bacterias púrpura y verdes del azufre

Hace algo cercano a 2,500 millones de años, sea por endosimbiosis seriada entre linajes de bacterias con maquinarias complementarias tipo I y tipo II, sea por adquisición de un segundo fotosistema por evolución propia , o sea por transferencia genética horizontal entre linajes, en lo que podría ser una especie de endosimbiosis bioquímica, de alguna manera dos maquinarias fotosintéticas se combinaron resultando en una máquina dotada de un “carburador de doble venturi” capaz de oxidar el agua, lo que marcó un punto de no retorno en la vida del planeta.

La utilización de agua como fuente de electrones en éste novedoso proceso fotosintético ha sido de lejos la más importante y trascendental innovación evolutiva alcanzada en el planeta. El nuevo recurso eliminó la dependencia de electrones procedentes de fuentes de limitado acceso (H2S, moléculas orgánicas, etc) permitiendo que las cyanobacterias pudieran ocupar todos los rincones del planeta donde hubiera agua líquida, convirtiendose así en el grupo más exitoso y de lejos más dominante que haya existido hasta la fecha .

Pero esta dominancia tuvo su lado obscuro, pués también fué la responsable de alterar profundamente la atmósfera primigenia, rica en dióxido de carbono y metano, por una atmósfera de oxígeno, lo que amenazó seriamente las formas de vida anoxigénica que prosperaban en ese entonces .

POOL DE QUINONAS

Como se mencionó anteriormente, el pool de quinonas es un depósito de quinonas oxidadas y reducidas ubicada en el espacio intramembrana tylakoidal, adyacente a los complejos fotosintéticos PSII, PSI y al Cyt b6f.

La naturaleza hidrofóbica de las quinonas permite que éstas permanezcan confinadas en dicho espacio, repelidas por los radicales fosfato de la capa bifosfolipídica.

La proporción y concentraciones de las formas PQ / PQH2 es dinámica y depende de los requerimientos fisiológicos, siendo PQH2 la portadora de energía desde PSII hacia en citocromo b6f.

CITOCROMO b6f

El complejo Cyt b6f es un complejo proteínico transmembrana con moléculas Heme como cofactores, ver Fig 10. Sus funciones consisten en transferir electrones al fotosistema PSI orientados a síntesis de NADPH y mover protones del citoplasma al lumen thylakoide mediante una secuencia de oxidaciones y reducciones de quinonas aprovechando una cadena de transporte de electrones ETC habilitada por cambios reversibles entre los estados de oxidación Fe³⁺ / Fe²⁺ de átomos de hierro presentes en moléculas Heme al interior del complejo.

Fig 10. Estructura del citocromo Cytb6f, y dinámica de transporte de electrones ETC.

La subunidad Cyt B6 tiene dos sitios activos, Qp oxidante y Qn reductor, responsables de alojar las quinonas a oxidar y reducir, respectivamente.

Del pool de quinonas es transladada una molécula PQH2 a Qp donde es oxidada a su forma PQ. Dos protones y dos electrones son liberados en la reacción. Los protones migran al lumen htilakoide donde contribuyen a incrementar la fuerza protomotriz PMF que luego se utilizará pra la síntesis de ATP.

En cuanto a los electrones, tienen dos destinos diferentes:

El primer electrón es capturado por el complejo 2Fe2S, cofactor de la proteína Rieske (Iron Sulfur Protein ISP) quien a su vez reduce una cuproproteina móvil presentee e el lúmen thylakoide denominada Plastocianina, responsable final de la transferencia de electrones desde Cyt b6f hasta PSI siguiendo la ruta

Qp → Cytf → [2Fe2S] → PC → P700

En cuanto a Rieske, el centro [2Fe2S] está coordinado por dos histidinas y dos cisteínas, en lugar de las cuatro Cystinas que caracterizan a la ferredoxina [2Fe2S], ver Fig 11.

Fig 11. Centro [2Fe-2S] presente en la proteina Rieske

Respecto a la Plastocianina (PC), se trata de una proteína móvil transportadora de electrones con un átomo de cobre como cofactor anclado a la proteina mediante cuatro ligandos: Imidazol de dos residuos histidina (His37, His87) , thiolato de Cys84 y thioether de Met92, lo que le confiere una estructura de tetrahedro irregular. Durante el proceso el cobre es reducido de la forma

Cu²⁺ → Cu⁺

En estado reducido, PC migra en el lumen hasta el PSI, donde dona el electrón a P700⁺, volviendo a su forma oxidada Cu²⁺.

Respecto al segundo electrón, este sigue la ruta

bl → bh (o bl → cn) → PQ

mediante cambios en los estados de oxidación Fe3+ – Fe2+ de los Heme correspondientes, para finalmente reducir parcialmente una plastoquinona PQ localizada en el sitio Qn .

Son necesarios dos ciclos como el descrito arriba para reducir completamnte la plastoquiuinona PQ localizada en Qn.

Una vez totalmente reducida, la plastoquinona incorpora dos protones procedentes del citoplasma a su estructura, retornando luego al pool de quinonas en su forma PQH2 .

Completados los dos ciclos, cuatro protones son transladados del citoplasma al lumen tylakoidal.

FOTOSISTEMA PSI

El fotosistema PSI es el último complejo involucrado en la cadena de transporte de electrones, su función es reducir NADP+ a partir de la oxidación del átomo de cobre precente en PC, por lo cual se conoce atmbién como Plastocianina-NADP Oxidoreductasa., ver Fig 12.

Figura 12. Fotosistema PSI. Estructura y cadena de transporte ETC

Como en el caso de PSII, complejos antena tipo phycobilisomas son responsables de transferir la energíalumínica al par especial de clorofilas, en este caso al dímero P700, con la energía necesaria para que un electrón sea liberado del par especial iniciando la cadena de transporte correspondiente.

Una vez liberado el electrón, el par especial adquiere el potencial oxidante necesario para oxidar la plastocianina PC procedente del complejo Rieske, retornando el par especial a su estado Ground, cambiando el estado de oxidación del átomo de cobre:

Cu⁺ → Cu2

Dos ramas simétricas de cofactores están presentes en PSI. Las ramas parten de P700 al interior de las subunidades PSaB y PSaA, cada una conteniendo una molécula accessoria de Chla ( A), una segunda monomérica Chla ( A0) y una filoquinona (A1). Las dos ramas convergen en un cluster [4Fe-4S] central (Fx), ver Fig 13, apuntando hacia el citoplasma.

A pesar de existir dos ramas paralelas de cofactores A-Ao-A1, solo una es responsable de la cadena de transporte de electrones, usualmente la rama localizada en PSaA, mientras que la segunda rama, presente en PSaB , permanece inactiva.

De Fx la energía es transferida hacia dos cluster [4Fe-4S] denominados FA y FB localizados en la subunidad proteínica PsaC, para finalmente reducir una ferredoxina 2Fe-2S Fe-S , denominada Fdx, localizada en el citoplasma.

La ferredoxina requere dos electrones para reducirse completamente, de modo que dos ciclos secuenciales PC-Ferredoxina deben ser completados.

Éste agente reductor no transfiere directamente electrones a NADP+ , requiriendo una enzima intermediaria denominada ferredoxina-NADP+ reductasa (FNR). La transferencia de electrones se realiza en dos pasos:

FNR → Flavin-Semiquinona → FADH2

Una vez completamente reducida, FNR transfiere los dos electrones a NADP+ .

En resumen, la cadena de transporte ETC en PSI sigue los siguientes pasos:

P700∗ → A → A0 ​→ A1 ​→ Fx ​→ FA ​→ FB ​→ Fdx → FNR – NADPH

OXIGEN EVOLVING CENTER OEC

Con la síntesis de NADPH y la habilitación de síntesis de ATP mediante la generación de fuerza protomotríz PMF por el sistema parecería que el tema quedaría cubierto.

Sin embargo queda pendiente el tema de reposición de electrones en PSII para que la maquinaria fotosintética pueda operar ininterrumpídamente.

La oxidación de P680 inicializa el fljo ETC mediante la cesión electrónica, pero a su vez, gracias al alto poder oxidante adquirido, permite reincorporarlos desde la fuente primaria, H2O, mediante una innovacion evolutiva, El ciclo de Joliot-Kok mediado por Mn4CaO5 , ciclo que opera en un complejo proteínico denominado Oxigen Evolving Center, “OEC”.

Como core del complejo OEC y como centro oxidante se presenta una molécula de estructura cubana, ver Fig 13, y fórmula molecular Mn4CaO5, responsable final de la oxidación del agua.

Figura 13. Diagrama 3D de la molécula Mn4CaO5. Se incluyen en la molécula las cuatro moléculas coordinadas de agua

El tránsito de electrones desde MnCaO5 hacia el par de clorofilas es mediado por un residuo Tyr 161 (Yz), en la secuencia

H2O → Mn4CaO5 → Yz → P680*

Al ceder electrones, P680* adquiere un potencial oxidativo muy alto (~+1,25v) , lo que permite oxidar Tyr161 quien a su vez oxida MnCaO5 para que tras un ciclo repetido pueda oxidar el agua , ver Fig.14.

Figura 14. Ciclo de KOK. Las cuatro barras en cada estado representan los cuatro átomos de manganeso, barras azules indican átomos en estado de oxidación III, barras rojas estado IV.

Como etapa previa al ciclo de KOK, la energía de un fotón procedente del complejo antena promueve la liberación de un electrón en P680, lo que lo lleva a un estado P680* altamente oxidativo. Este potencial es transladado al centro OEC con el propósito final de oxidación del H2O.

El elemento responsable de los estados de potencial corresponde a los cuatro átomos de Mn, que pueden tener los siguientes estados de oxidación:

Mn neutro: [Ar] 3d⁵ 4s²

Mn(III): [Ar] 3d⁴ (Paramagnético, 4 electrones despareados)

Mn(IV): [Ar] 3d³

Las etapas del ciclo de KOK se pueden resumir así:

  • S0 → S1: Partiendo de un estado inicial en Mn4CaO5 con Mn1 – Mn3 en estado de oxidación III y Mn4 en estado de oxidación IV, P680* promueve la oxidación de Tyr161 y luego la oxidación de Mn3 en Mn4CaO5 (con la consecuente reposición electrónica en P680), lo que genera en el core de OEC un potencial de +0,8v.
  • S1 →S2: Segundo fotón incidente, segundo electrón liberado, se eleva el potencial oxidativo del core a de +0,8v a 0,9v , oxidación de Mn2 pasando del estado MnIII a MnIV, liberación de H+ al lumen thylakoide.
  • S2 →S3: Tercer fotón incidente, tercer electrón liberado, captura de una primera molécula de agua, liberación de H+ al lumen thylakoide, el core adquiere un potencial de ~+1,0 – +1,1, oxidación de Mn1 pasando del estado MnIII a MnIV.
  • S3 →S4 → S0: Cuarto fotón incidente y cuarto electrón liberado. Con todos los átomos de Mn en estado de oxidación +IV, el potencial de oxidación general es lo suficientememnte alto como para generar un enlace O-O a partir de H2O, de manera que sus electrones se puedan incorporan al sistema, retornando de paso los estados de oxidación de los átomos de Mn a sus condiciones iniciales para así poderse iniciar un nuevo ciclo.

S2 y S3 son estados metaestables, particularmente en ausencia o deficiencia de luz, pudiendo decaer el sistema a S0, lo que hace que el poder oxidante acumulado se pierda.

La secuencia presentada se basa en un modelo de oxidación de “valencia alta” (High valence), caracterizada por átomos de Mn en estados de oxidación III y IV.

Este modelo presupone en la etapa S4, previa la formación del enlace O-O, la oxidación de un átomo de Mn a un estado V, estado energéticamente extremo, difícil de explicar bajo el modelo de Lewis y en conflicto con algunos datos espectroscópicos experimentales.

Una segunda alternativa se basa en un modelo de bajo potencial (Low potential), en el que no es necesario recurrir a estados de oxidación extremos y donde la energía adicional es resuelta mediante Radicales Oxyl (O.), Puentes Oxo deprotonados y Oxidación centrada en ligandos, y no en los átomos de Mn.

Bajo este modelo, el manganeso Mn1 participa en S0 con un estado de oxidación II , y en general, a lo largo de todo el ciclo, los estados de oxidación del core son menores que los del modelo de potencial alto, ver Fig 15.

Este modelo explica de mejor manera el ciclo, no es necesario recurrir a estados energéticos extremos, pero por otro lado el hecho de manejar menores potenciales de oxidación abre interrogantes sobre la capacidad de oxidación del agua.

Para concluir, la sinergia bioquímica resultante de combinar los fotosistemas PSII y PSI en una única maquinaria fotosintética fuertemente oxidante y a la vez fuertemente reductora, sumado al desarrollo de un novedoso complejo bioquímico diseñado para extraer electrones del agua, permitió que toda una nueva propuesta bioquímica, la de las formas de vida aerobia, conquistara el planeta en una explosión evolutiva que aún hoy, después de 2,500 millones de años, nos acompaña.

Lidiar con el oxígeno, sin embargo, no ha sido tarea fácil para la vida, e incluso la maquinaria fotosintética que lo liberó por primera vez debe lidiar con él.

Los mecanismos de protección ROS, y en general las rutas de control diseñadas para proteger la maquinaria fotosintética, serán el tema de la próxima lectura.

XI. FOTOSÍNTESIS EN BACTERIAS VERDES DEL AZUFRE (GSB)

Las bacterias verdes del azufre son un grupo bacteriano Gram (-) fotolitoautótrofo metabólicamente especialista, pertenenecen a la clase Chlorobia, Phyllum Bacteroidotas, caracterizadas por ser anaerobias estrictas .

Propias de ambientes anóxicos en fondos de lagos con alto contenido de azufre, utilizan H2S y en menor medida tiosulfatos y So elemental como donores de electrones, carecen del ciclo reductor de Calvin-Benson, en reemplazo fijan CO2 mediante el ciclo reverso del ácido tricarboxílico.

Su aparato fotosintético contiene complejos antena altamente eficientes denominados clorosomas, los cuales les permiten prosperar a bajísimas intensidades de luz, siendo de hecho el grupo fotosintetizador con menores requerimientos de energía lumínica reportado a la fecha.

Este grupo bacteriano utiliza el centro de reacción RC para producir reductantes fuertes, ATP y NADPH, mediante la oxidacion de los compuestos del azufre anteriormente mencionados.

Para activar la cadena de transporte de electrones, RC contiene como cofactor prostético un par de bacterioclorofilas BChla exitable a 840 nm, que les permite pasar de un estado GND un estado exitado P840*, ver Fig. 1.

Figura 1. Potenciales REDOX en la cadena ETC de las bacterias verdes del azufre.

P840 es indispensable para:

  • Recepción de energía lumínica proveniente de los complejos antena
  • Separación de cargas
  • Transferencia de electrones a clusters de proteinas-ferrodoxinas Fe–S, a niveles de energía mucho menores (mas negativos) que los requeridos por las quinonas de bacterias púrpura, lo que permite reducir directamente NAD+.

ETC transfiere la energía desde el par BChla exitado hacia FeSA/B, y finalmente a ferrodoxinas Fd citoplasmáticas altamente reductoras, (514-584 mV) , lo que proporciona potenciales suficientes para reducir NADP + vía ferrodoxina/NADP+ oxidoreductasa, lo que habilita las cadenas memtabólicas responsables de la fijación de carbono.

En cuanto a la síntesis de ATP, a la fecha no hay claridad sobre la ruta responsable de generación de la PMF requerida para la activación de ATP synthase.

En primer lugar, en la cadena de transporte de electrones no participan de manera directa quinonas, y solo menaquinona MK7 está presente en lo que prodría definirse como pool de quinonas.

Por otro lado, a pesar de que GSB contiene genes codificantes de Cyt b y Rieske Fe/S (PetB y PetC respectivamente), no ha sido descrito a la fecha genoma codificador de Cyt c1 y Cyt f , de manera que una ruta cíclica equivalente a la vía Cyt bc1 de bacterias púrpura no ha sido demostrada para GSB. El rol de Cyt b y Rieske Fe/S en el complejo es sujeto de investigación.

De manera alterna, es posible que la acción combinada de ferredoxina como agente reductor de MK7 y NADP deshidrogenasa como fuente de protones, ver Fig.2., permita generar MKOH, de modo que la translocación de protones en una etapa oxidativa subsiguiente de MKOH -> MK7 para síntesis de ATP pueda ocurrir . La reducción de MK7 puede tambien provenir de FeS o la fuente de electrones del sistema. Independiente del agente reductor, no ha sido posible caracterizar complejos oxidantes de MKOH que soporten la teoría, así que la ruta de generación de PMF y retorno de electrones al sistema en alguna vía alterna a Cytc1-Cyt C soluble también está por aclararse. En la Fig 2., las líneas punteadas representan rutas probables no demostradas.

Figura 2. Diagrama de flujo de las probables rutas fotosintéticas en GSB, incluyendo consumo de NADPH para síntesis de ATP. Líneas punteadas indican rutas no demostradas.

Para complementar el tema, la Fig 3 describe la ruta de síntesis de NADPH en bacterias púrpura mediante el consumo de ATP.

Figura 3. Diagrama de flujo de la síntesis de NADPH a partir de consumo de ATP en bacterias ´púrpura

En resumen, mientras que en bacterias púrpura, debido a su naturaleza débilmente reductora, se hace necesario “invertir” parte del ATP producido para sintetizar NADPH, en GSB, dada su naturaleza fuertemente reductora pero débilmente oxidante, una fracción de NADPH es la que se debe utilizar durante la síntesis de ATP.

Puesto que la incorporación de carbono a partir de CO2 depende de la disponibilidad tanto de NADPH como de ATP en las rutas reductoras (Ciclo de Calvin-Benson y TCA Reverso, entre otros) , y puesto que parte de estos agentes debe ser direccionado hacia la síntesis de los mismos, los aparatos fotosintéticos de Bacterias púrpura y GSB tienen en común una eficiencia limitada. La situación en bacterias púrpura y GSB recuerda la paradoja de la serpiente, quien para sobrevivir, requiere alimentarse de sí misma.

Figura 4. Paradoja de la serpiente

Hace unos 2,000 millones de años, en un proceso de endosimbiosis bioquímica, dos grupos bacterianos, con rutas bioquímicas similares a las mencionadas, fusionaron de alguna manera sus maquinarias fotosintéticas dando origen a un único complejo fuertemente oxidante, fuertemente reductor, lo que por un lado eliminó la necesidad de consumo de productos reductores para síntesis de sí mismos, y por otro lado habilitó la utilización de H2O como una nueva e ilimitada fuente de electrones.

Las consecuencias de dicha convergencia evolutiva marcaron un punto de inflexión en la vida en el planeta, pero esto será tema para las próximas lecturas.

Finalmente, y para cerrar la lectura, la figura 5 desribe de manera resumida el aparato fotosintético en GSB.

Figura 5. Aparato fotosintético en bacterias verdes del azufre

FOSFORILACIÓN OXIDATIVA

La “Fosforilación oxidativa” corresponde al proceso de captura de energía por parte de los organismos con respiración celular aerobia, incluyendo eucariotas (plantas, animales, hongos y protistas) y procariotas (bacterias y arqueas aerobias).

El término “Fosforilación oxidativa” resume de la mejor manera su función: “Fosforilación”, como objetivo, pues se trata de una maquinaria orientada a ACUMULAR ENERGÍA representada por radicales en ATP, y por otro lado “Oxidativa”, como requisito, pues la maquinaria opera mediante la oxidación (o extración de energía) de las coenzimas NADH y FDH2 procendentes del ciclo del Ácido Tricarboxílico (TCA) .

TCA a su vez opera como un intermediario en el tránsito de energía entre moléculas ricas en energía (carbohidratos y ácidos grasos) y la maquinaria fosforilativa.

PROCESO

La glucosa, donador principal de energía a la maquinaria fosforilativa, ingresa a la célula por dos vías:

1. A favor de gradiente (Difusión Facilitada) , sin requerirse ATP en el proceso, mediante transportadores de glucosa (GLUT).

2. En contra de gradiente (Trasporte Activo Secundario) mediante transportadores SGLT (Sodium-Glucose Linked Transporter), aprovechando las bombas Na⁺/K⁺ .

La familia de transportadores GLUT comprende 14 proteinas 12-transmembrana, GLUT1 a GLUT14, agrupadas en tres clases, todas con las terminales N y C expuestas al citoplasma.

El transportador GLUT4, en particular, es regulado por la insulina, cuya presencia en el torrente sanguineo inicia un proceso de transducción de señal que al completarse permite que GLUT-4 (almacenado en vesículas libres) se incorpore a la membrana celular para cumplir su función de transporte de glucosa hacia el citosol.

La regulación de glucosa por la insulina se sale de los objetivos de la presente lectura, pero definitivamente justifica un lectura aparte.

En el citosol, por la ruta de la glicólisis, cada molécula de glucosa es convertida en dos moléculas de Piruvato, las cuales ingresan a la mitocondria, también mediante difusión facilitada, con la participación de una proteína especializada presente en la membrana interna mitocondrial denominada MPC (Mitochondrial Pyruvate Carrier).

Finalmente, al interior de la mitocondria, el Piruvato cede su radical Acetil a la Coenzima A (CoA) mediante la enzima Piruvato-deshidrogenasa, lo que permite generar Acetil-Coenzima A (ACoA), molécula que activa el ciclo del ácido tricarboxílico o ciclo de Krebs. ACoA también es generado por radicales acil provenientes de la Beta-Oxidación de ácidos grasos, los cuales ingresan a la mitocondria en forma de Acil-Carnitina.

ACoA incorpora los dos carbonos del radical acil al oxaloacetato para regenerar citrato, lo que de paso define el nombre alterno del TCA (Ciclo del ácido cítrico).

TCA existe con el propósito fundamental de abastecer de combustible a la cadena fosforilativa en forma de FADH2 y NADH. Por cada molécula de glucosa se producen seis moléculas de NADH, dos de FADH2 y dos moléculas de GTP.

La maquinaria responsable de la fosforilación oxidativa (activada por NADH y FADH2) comprende cuatro complejos bioquímicos, numerados I a IV, los cuales tienen como función en conjunto generar un gradiente protónico entre la matriz y el espacio intermembrana de la mitocondria. Este gradiente a su vez alimenta la ATP Synthasa, lo que permite acumular energía en forma de ATP, de manera similar a como lo hacen los complejos fotofosforilativos en los organismos fotosintetizadores y a la fosforilación quimiosmótica propia de algunas bacterias y arqueas anaerobias (E. coli, desulfovibrio y arqueas metanógenas).

COMPELEJO I: NADH-UBIQUINONA OXIDOREDUCTASA

Encargado de la captura de energía almacenada en NADH, bombea cuatro iones H+ por cada molécula de NADH que ingresa al complejo. En el bombeo iónico participan numerosas moléculas de agua precisamente dispuestas al interior de las subunidades proteicas transmembrana PD y PP. (subunidades Distal y proximal transmembrana respectivamente), si bién su participación y manera de acción no está bién entendida.

El bombeo de protones contra gradiente es habilitado mediante una cadena de transporte de electrones (ETC) en el sentido NADH -> Ferredoxinas -> Ubiquinona , culminando con la reducción de la Ubiquinona y exportación de la misma en forma de Ubiquinol al pool de quinonas.

COMPLEJO II: SUCCINATO-UBIQUINONA OXIDOREDUCTASA

Es el único de los cuatro complejos que no realiza transporte de protones desde la matriz hacia el espacio intermembrana. De igual manera, único complejo intimamente Ligado al TCA, concretamente en la etapa de oxidación de Succinato a Fumarato, reduciendo FAD a FADH2, lo que activa una cadena de transporte de electrones en el sentido FADH2 -> Ferrredoxinas -> Heme -> Ubiquinona, las cuales finalmente son exportadas al pool de quinonas en su forma reducida.

COMPLEJO III: CITOCROMO bc1

Aceptor de las quinonas reducidas exportadas por los complejos I y II, captura los electrones del ubiquinol liberando 2 H+ por molécula los cuales se exportan al espacio intermembrana contribuyendo al gradente protónico (PMF).

Citocromo bc1 , al igual que b6f en los complejos fotosintéticos, enruta el primer electrón producto de la oxidación de la molécula de ubiquinol hacia una cadena de transporte de electrones compuesta por dos hemes BL -> BH para en el sitio Qi reducir parcialmente una molécula oxidada UQ2+ -> UQ+ . El segundo electrón es enrutado hacia el complejo Rieske proximal al espacio intermembrana, de allí a Cyt c1 y finalmente al cyt c soluble que se mueve hacia el complejo IV. El proceso reductor se repite para reducir completamente la ubiquinona parcialmente reducida UQ+ -> UQ2+ permitiendo regenerar en el pool de quinonas el primer ubiquinol extraído.

COMPLEJO IV: CITOCROMO C OXIDASA

Responsable del destino final de los electrones producto de las cadenas ETC de la maquinaria fosforilativa, produce agua a partir de O2 y H+ presentes en la matriz mitocondrial.

El complejo IV contribuye al PMF por dos vías: Por un lado consumiendo H+ en la matriz mitocondrial, y por otro lado transportando activamente H+ de la matriz hacia el espacio intermembrana, proceso mediado por su propia cadena ETC .

El complejo IV contiene dos centros de cobre:

  1. Centro CuA: Contiene dos iones de cobre, siendo responsable de recibir los electrones provenientes de CytC, para luego transferirlos al centro catalítico CuB del complejo.
  2. Centro CuB: Contiene un ión de cobre, que junto con un Heme a3 recibe los electrones de CuA para reducir completamente O2 a H2O evitando de paso que los electrones libres formen especies reactivas de oxígeno.

ATP SYNTHASE

Aunque técnicamente no forma parte del aparato fosforilativo, este complejo es el encargado de aprovechar el gradiente protónico para sintetizar ATP a partir de ADP, propósito único de la fosforilación oxidativa.

ATP Sintasa es una verdadera máquina ensambladora rotativa de tres tiempos: Admisión -> Compresión -> Expulsión, con sus centros activos separados 120° entre sí, utiliza para la rotación el gradiente protónico H+ generado por el aparato fosforilativo.

En algunas bacterias marinas anaerobias halófilas, propias de ambientes muy alcalinos, donde H+ no puede operar, ATP Sintasa utiliza de manera alternativa Na+ para generar la rotación requerida para la síntesis de ATP.

Angiospermas: Ciclo de vida

Aunque está suficientemente documentado el ciclo de vida de las Angiospermas, no es fácil encontrar diagramas lo suficientemente claros y autocontenidos, de manera que incluyo uno que espero cumpla las condiciones mencionadas.

Como se puede apreciar en la figura, en las angiospermas el grano de polen o microgametofito se compone de solo dos células con sus correspondientes nucleos espermáticos, lo que contrasta con las gimnospermas, en las cuales el microgametofito desarrolla cuatro células: Dos células protálicas vestigiales, resultado de la evolución a partir de antepasados con gametofitos masculinos más complejos, mas una célula generativa y una célula formadora del tubo polínico, estas dos últimas procedentes de la división mitótica de la célula anteridial.

Retornando a las angiospermas, mientras un nucleo fecunda el óvulo, dando lugar a un embrión diploide, el segundo nucleo fecunda la célula polar binucleada para generar el endospermo triploide 3N.

La doble fertilización, la simplificación del grano de polen a solo dos células, y la generacción de un endospermo triploide son considerados los principales diferenciadores entre Angiospermas y Gimnospermas.

La estrategia de contar con un endospermo 3N tiene varias implicaciones :

  1. MAYOR RESERVA NUTRICIONAL: Contar con una dosis extra de genes se traduce en una mayor capacidad biosintética de recursos nutricionales.
  2. BALANCE GENÓMICO DIFERENCIAL MADRE/PADRE: Puesto que 2/3 del genoma del endospermo provienen de la madre (nucleos polares), hay un mayor control materno sobre el uso de los recursos nutricionales consumidos por el embrión. (ver “Teoría del Conflicto Parental” más adelante).
  3. OPTIMIZACIÓN DE RECURSOS: La doble fecundación garantiza que el endospermo solo se forme si hay fecundación previa del óvulo, de modo que no se desperdicien recursos formando tejido nutritivo innecesario (ahorro en energía y en recursos).
  4. EFICIENCIA Y SINCRONIZACIÓN: Contar con un endospermo que pueda desarrollarse de manera independiente al desarrollo del embrión permite que la disponibilidad de recursos nutricionales se ajuste a los requerimientos nutricionales del embrión.

TEORÍA DEL CONFLICTO PARENTAL

La “Teoría del Conflicto Parental” , o “Teoría del Conflicto genómico“, fué propuesta por David Haig y Mark Westoby en 1989 tratando de explicar los justificantes de un endospermo triploide con alelos madre/padre diferenciales 2:1.

Como idea central, la teoría expone que existe un “conflicto de intereses” entre los genes de la madre y los del padre respecto a los recursos requeridos para el desarrollo de los embriones.

Desde el punto de vista de los intereses maternos, y puesto que las semillas pueden provenir de distintos padres, distribuir equitativamente los recursos asegura la supervivencia del mayor número de progenie. Al fín y al cabo, todas las semillas portan sus genes.

El control materno limita en buena medida los intereses paternos, que consisten en asegurar la mayor cantidad de recursos para su descendencia, a costa de recursos para la demás progenie.

Otras dos teorías han sido propuestas para explicar el diferencial genómico.A continuación se presentan de manera simplificada, pues exceden los propósitos de la presente lectura:

TEORÍA DE COADAPTACIÓN MATERNO-FILIAL

Propuesta por Wolf y Hager, 2006, Wolf y Hager, 2009; Wolf, 2013, aplicable no solo a plantas, resalta la idea de coadaptación (más que conflicto entre intereses genéticos madre-hijo, ver teoría de Haig, 1990´s) , lo que resulta en coevolución y sincronía adaptativa de mutuo beneficio madre-embrión.

TEORÍA DEL ANTAGONISMO SEXUAL

Day y Bonduriansky, 2004; Bonduriansky, 2007.

De acuerdo a la teoría, existen genes que afectan de manera diferencial el éxito reproductivo de machos y hembras, conduciendo a que una misma variante genética puede beneficiar a un sexo y perjudicar al otro.

Esto genera un antagonismo sexual y una tensión evolutiva entre las adaptaciones masculinas y femeninas.

BIBLIOGRAFIA RECOMENDADA

Day T, Bonduriansky R. Intralocus sexual conflict can drive the evolution of genomic imprinting. 2004. Genetics 167: 1537–1546.

Haig D, Westoby M. Parent-Specific Gene Expression and the Triploid Endosperm. Am. Nat. 1989. Vol. 134. pp. 147-155.

Wolf J, Hager R. A Maternal–Offspring Coadaptation Theory for the Evolution of Genomic Imprinting. PLoS Biology. 2006. Vol 4 Issue 12 e380

Observaciones preeliminares sobre el comportamiento de la Marea barométrica en Subachoque (Cundinamarca, Colombia)

Al igual que las mareas oceánicas presentan ciclos semidiurnos, esto es, ciclos que se repiten cada doce horas, definidos por las atracciones combinadas del sol y la luna sobre las aguas oceánicas, la atmósfera presenta igualmente ciclos semidiurnos, si bien sus causas no estan totalmente entendidas, aunque parece influir en gran medida la absorción UV por parte de la capa de Ozono.

Le Blanck (2011) comparó los ciclos de mareas barométricas correspondientes a tres localidades diferentes:

1. Panjim (Goa) 15 ° N 74 ° E: Estación tropical en la costa occidental de la India.

2. Malé (Islas Maldivas) 4 ° N 74 ° E: Estación ecuatorial.

3. Jersey (Islas del Canal) 49 ° N 2 ° O: Estación de latitud media en el Canal de la Mancha.

Como se puede apreciar en la Fig 1., las horas de picos de marea barométrica son coincidentes para las tres localidades, si bien los delta de presión son mucho mas marcados en las regiones tropicales que en las regiones subtropicales, superando los 3 mB de diferencia entre picos altos y bajos en regiones ecuatoriales y tropicales, y algo cercano a 0,8 mB en regiones subtropicales.

Figura 1. Ciclos de mareas atmosféricas medidos en tres localidades, Ecuatorial, tropical subtropical.. Fuente: Le Blanck, 2011.

Para los tres casos, los mínimos diarios ocurren hacia las 3:30 AM y 3:30 PM, respectivamente, mientras que los máximos se presentan hacia las 11:00 AM y 11:00 PM, siendo importante resaltar que el pico alto de medio día es mayor que el pico alto de la tarde.

En la Reserva Biológica Pass&Flora, localizada en el municipio de Subachoque, Cundinamarca, Colombia, coordenadas 4.946137, -74.173708 , se cuenta con un sensor de Presion Barométrica instalado a 3,5 mt de altura sobre el nivel de suelo al interior de un robledal, enviando información en tiempo real a la nube cada 10 minutos.

La Fig 2. presenta las mediciones de presión atmosférica para la semana del 2-9 de octubre 2025.

La coordena X corresponde a las mediciones, que , como se mencionó, son colectadas cada 10 minutos, y la coordenada Y la presión en milibares (o HPa).

En la esquina superior de la figura se resumen los valores promedio, tanto de momento de picos, con precisión de minuto, así como de los valores promedio de presión correspondientes a dichos picos, precisión +/- 1 hPa, resolución 0,1 hPa.

Figura 2. Mareas de presion barométrica, correspondientes a la semana del 2-9 de octubre, 2025,en la reserva Pass&Flora.

Los resultados son coherentes con los datos presentados por Le Blanck para localidades ecuatoriales, con deltas de presión entre picos cercanos a 3 hPa. De igual manera, los momentos de picos en la marea barométrica son coherentes con los presentados por Le Blanck.

Por tratarse de una localidad a 2,750 MSNM, extiende o generaliza aún más el comportamiento esperado, dada la ubicación de la localidad ecuatorial con la que se puede hacer comparación directa (Malé, Islas Maldivas), con restricciones de comparación dado que malé se encuentra a nivel del mar, más teniendo en cuenta que Le Blanck solo presenta información de variación en presión, y no presión medida, por lo cual no es posible realizar comparaciones mas a profundidad entre Malé y Subachoque.

Finalmente, aunque la información analizada corresponde a datos de tan solo una semana, vale la pena resaltar la consistencia de resultados medidos en los picos día a día, calculada como la desviación standard de la muestra. Particularmente estable la presion del pico alto de la mañana, con un valor de desviación estandard = 0,29, lo que genera un valor poblacional entre 740,08 -741,2 con el 95% de confianza.

Figura 3. Picos promedio de presión en la marea barométrica y estadísticas de distribución de la muestra medida.

Bibliografía citada

“Diurnal pressure variation: The atmospheric tide”. Frank Le Blancq. Jersey Meteorological Department, Weather (2011)